Maki szybciej liczą geny

Apple nawiązała współpracę z firmą Genentech, której efektem ma być szybsza wersja bioinformatycznego systemu BLAST, wykorzystywanego przez National Center for Biotechnology Information (NCBI) w projektach związanych ze strukturą genów.

Zgodnie z oświadczeniem prasowym Apple, system PowerMac z podwójnym procesorem G4 1GHz i oprogramowaniem Apple/Genentech BLAST jest pięciokrotnie szybszy od układu 2 GHz Pentium 4 pracującego ze standardową wersją programu BLAST wykorzystywaną przez NCBI. 'Apple i Genentech dramatycznie zwiększyły wydajność niezwykle istotnego narzędzia w pracach biomedycznych. Jestem zdumiomy faktem, że na maszynie na którą stać przeciętnego naukowca takiej jak chociażby Power Mac G4, standardowa dla naszego przemysłu aplikacja BLAST pracuje szybciej niż na o wiele droższych komputerach', oświadczył profesor David Botstein ze Stanford University Genetics Department. PowerMac Velocity Engine umożliwia przeprowadzanie licznych operacji jednocześnie oraz analizowanie olbrzymich ilości danych w stosunkowo krótkim czasie. Układ PowerMac G4 z podwójnym procesorem 1GHz pracuje z szybkością 15 gigaflopów czyli wykonuje miliard operacji zmiennoprzecinkowych na sekundę, co w połączeniu z wydajnym systemem Mac OS X (opartym na założeniach Unixa) stwarza optymalne środowisko dla wymagających projektów związanych ze obliczaniem sekwencji genów. Apple/Genentech BLAST to projekt typu 'open source', którego kod można pobrać darmowo z witryny Apple.

http://developer.apple.com/hardware/ve/acgresearch.html


Zobacz również